生物物理所等在遺傳編碼膦配體及人工金屬蛋白(酶)設計研究中獲進展
軍工資源網 2022年11月30日11月23日,中國科學院生物物理研究所王江云課題組和清華大學陳永湘課題組,在JACS上,發(fā)表了題為Genetically Encoded Phosphine Ligand for Metalloprotein Designn的研究論文。該工作首次運用遺傳密碼子擴展(GCE)策略,將非天然的膦配體引入生命體系,進而發(fā)展了含非天然膦配體的人工金屬蛋白(酶)的構建策略。
自然界和生物體中,作為構成生命體的重要元素,磷元素多以+5價的化合物形式存在于生命體系中,并發(fā)揮重要的生理功能。+3價磷因特殊的電子結構而具有更豐富的功能特性,但由于地球生物圈處于富氧環(huán)境的局限,生物體幾乎沒有進化出利用低氧化態(tài)磷的運行法則?;瘜W家可以將+3價的磷元素發(fā)展為N、O、S元素之外的一種重要的催化劑配體,即膦配體,并化學進化出具有特殊催化活性的過渡金屬催化劑,發(fā)展出較多自然界不存在的反應類型,將這些成果、智慧拓展到生物進化體系,進而設計、構建新型的人工金屬蛋白,這是合成生物學中頗具前景的研究方向。
本研究克服了基因編碼膦配體的三個挑戰(zhàn):膦配體具有較強的氧敏感性,無法兼容在有氧條件下、細胞內的蛋白質生物合成過程以及生理條件下氨酰-tRNA合成酶的定向進化;金屬有機化學中的金屬配位、綴合過程多在惰性氛圍的手套箱等進行,普通的生化實驗條件下難以制備含膦配體的人工金屬蛋白(酶);膦配體結構一般均具有較大的體積、水溶性差。該研究首次實現了將低價態(tài)、非天然的膦配體通過GCE策略引入生命體系,插入蛋白骨架上的任意位點。
科研人員設計并合成了一種硼烷保護的含膦配體非天然氨基酸P3BF,其在水相、空氣條件下比較穩(wěn)定;經過篩選和定向進化得到一個能特異性識別P3BF的氨酰-tRNA合成酶突變體P3BFRS;借助遺傳密碼子擴展技術,在大腸桿菌內將P3BF插入了蛋白質的任意特定位點;首次解析了含非天然膦-硼(P-B)鍵、1.95?分辨率的蛋白質晶體結構。
此外,研究人員發(fā)展了一種可在水相、空氣的有氧條件下,簡便地一步直接將膦硼化合物P3BF轉化為膦-金屬復合物的新策略。該策略條件溫和、高效、綠色,與蛋白兼容,操作簡便,無需無氧處理,為蛋白質上的化學轉化提供了可行方案;根據實驗現象,對該一步法直接轉化反應進行初步的機理探究,給出可能的反應路徑。在此基礎上,本研究將膦硼非天然氨基酸P3BF插入了一種具有特殊空腔結構的LmrR蛋白,并利用一步法的直接轉化策略,在水相、空氣的條件下,構建了含膦-環(huán)鈀金屬復合物的人工金屬蛋白,發(fā)展了膦-金屬蛋白構建的新策略,為下一步實現人工金屬酶、甚至全細胞催化創(chuàng)造了有利條件。
研究工作得到國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學基金等的支持。
如何將非天然膦配體引入生命體系
非天然膦配體的生命體引入及人工金屬蛋白構建策略